Lê Văn Quý quê ở làng Xuân Tường, huyện Thanh Chương, tỉnh Nghệ An, là con trai của một nhà Nho tên là Lê Văn Ngạn với người vợ họ Nguyễn.[1]

Từ nhỏ, ông học Hán học từ cha. Lên 8, ông theo học thầy đồ Lê Văn Thám, sau đó đi học ở trường Quốc học Vinh. Trong thời gian này, ông được tiếp nhận những tư tưởng tiến bộ từ những quyền sách bị chính quyền Pháp cấm.[1]